MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1003 chromosome 1

Total Repeats: 90057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014539	TGA	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728077
2	NC_014539	CAG	2	6	416	421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
3	NC_014539	ACGTG	2	10	423	432	20 %	20 %	40 %	20 %	307728077
4	NC_014539	CGC	2	6	463	468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
5	NC_014539	GC	4	8	616	623	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
6	NC_014539	GCG	2	6	632	637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
7	NC_014539	GC	4	8	647	654	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
8	NC_014539	CGG	2	6	685	690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
9	NC_014539	GCGG	2	8	698	705	0 %	0 %	75 %	25 %	307728077
10	NC_014539	CGG	2	6	721	726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
11	NC_014539	CGC	2	6	730	735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
12	NC_014539	CGC	2	6	742	747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
13	NC_014539	GGC	2	6	763	768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
14	NC_014539	CG	4	8	775	782	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
15	NC_014539	GC	4	8	815	822	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
16	NC_014539	GCC	2	6	824	829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
17	NC_014539	CGAA	2	8	867	874	50 %	0 %	25 %	25 %	307728077
18	NC_014539	CGG	2	6	879	884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
19	NC_014539	CGC	2	6	887	892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
20	NC_014539	GC	4	8	1019	1026	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
21	NC_014539	CGG	2	6	1084	1089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
22	NC_014539	GC	3	6	1155	1160	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
23	NC_014539	GTG	2	6	1199	1204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728077
24	NC_014539	CGA	2	6	1228	1233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
25	NC_014539	CTA	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728077
26	NC_014539	CTG	3	9	1262	1270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728077
27	NC_014539	CGA	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
28	NC_014539	TCA	3	9	1362	1370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728077
29	NC_014539	CGA	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
30	NC_014539	GCC	2	6	1456	1461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728077
31	NC_014539	TGAA	2	8	1521	1528	50 %	25 %	25 %	0 %	307728077
32	NC_014539	TCG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728077
33	NC_014539	GC	3	6	1584	1589	0 %	0 %	50 %	50 %	307728077
34	NC_014539	AAG	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728077
35	NC_014539	CTG	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728077
36	NC_014539	AGA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728077
37	NC_014539	GAA	2	6	1759	1764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728077
38	NC_014539	CGG	2	6	1858	1863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728077
39	NC_014539	ACCAC	2	10	1869	1878	40 %	0 %	0 %	60 %	307728077
40	NC_014539	TGC	2	6	1881	1886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728077
41	NC_014539	CGA	2	6	1906	1911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
42	NC_014539	GCA	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728077
43	NC_014539	CCT	2	6	2230	2235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307728078
44	NC_014539	CGC	2	6	2270	2275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728078
45	NC_014539	CAC	2	6	2362	2367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307728078
46	NC_014539	GC	3	6	2368	2373	0 %	0 %	50 %	50 %	307728078
47	NC_014539	GCG	2	6	2388	2393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728078
48	NC_014539	CTC	2	6	2426	2431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307728078
49	NC_014539	GC	3	6	2440	2445	0 %	0 %	50 %	50 %	307728078
50	NC_014539	TCACGC	2	12	2463	2474	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307728078
51	NC_014539	CGC	2	6	2533	2538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728078
52	NC_014539	CAG	2	6	2645	2650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728078
53	NC_014539	CTA	2	6	2659	2664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728078
54	NC_014539	TGC	2	6	2676	2681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728078
55	NC_014539	GTG	2	6	2684	2689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728078
56	NC_014539	TCG	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728078
57	NC_014539	CG	3	6	2767	2772	0 %	0 %	50 %	50 %	307728078
58	NC_014539	CGA	2	6	2833	2838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728078
59	NC_014539	TGG	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728078
60	NC_014539	GAA	2	6	2984	2989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728078
61	NC_014539	CG	3	6	3008	3013	0 %	0 %	50 %	50 %	307728078
62	NC_014539	GAA	2	6	3113	3118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728078
63	NC_014539	ACG	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728078
64	NC_014539	TGC	2	6	3207	3212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728078
65	NC_014539	ACG	2	6	3264	3269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728078
66	NC_014539	GTG	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728078
67	NC_014539	ACA	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728079
68	NC_014539	CAC	2	6	3550	3555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307728079
69	NC_014539	GAC	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
70	NC_014539	AGCGC	2	10	3713	3722	20 %	0 %	40 %	40 %	307728079
71	NC_014539	CGG	2	6	3753	3758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
72	NC_014539	GGC	2	6	3790	3795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
73	NC_014539	GGCGTG	2	12	3802	3813	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	307728079
74	NC_014539	CGTG	2	8	3815	3822	0 %	25 %	50 %	25 %	307728079
75	NC_014539	AAG	2	6	3868	3873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728079
76	NC_014539	TGA	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728079
77	NC_014539	CGA	2	6	4002	4007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
78	NC_014539	GAA	2	6	4123	4128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728079
79	NC_014539	CGG	2	6	4143	4148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
80	NC_014539	CAA	2	6	4173	4178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728079
81	NC_014539	TGC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
82	NC_014539	GGCGTG	2	12	4231	4242	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	307728079
83	NC_014539	GTGCT	2	10	4282	4291	0 %	40 %	40 %	20 %	307728079
84	NC_014539	AAC	2	6	4297	4302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728079
85	NC_014539	CGG	2	6	4317	4322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
86	NC_014539	GC	3	6	4341	4346	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
87	NC_014539	CG	3	6	4355	4360	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
88	NC_014539	CGA	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
89	NC_014539	CGTG	2	8	4445	4452	0 %	25 %	50 %	25 %	307728079
90	NC_014539	GC	4	8	4521	4528	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
91	NC_014539	GAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728079
92	NC_014539	GTG	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728079
93	NC_014539	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
94	NC_014539	GCA	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
95	NC_014539	GC	5	10	4621	4630	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
96	NC_014539	GACGC	2	10	4659	4668	20 %	0 %	40 %	40 %	307728079
97	NC_014539	TCG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
98	NC_014539	GGC	2	6	4771	4776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
99	NC_014539	GCT	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
100	NC_014539	GAC	2	6	4927	4932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
101	NC_014539	CAT	4	12	4962	4973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728079
102	NC_014539	GC	3	6	4994	4999	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
103	NC_014539	GCT	3	9	5010	5018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
104	NC_014539	GAT	2	6	5046	5051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728079
105	NC_014539	GCC	2	6	5079	5084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728079
106	NC_014539	TGC	2	6	5183	5188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
107	NC_014539	GC	4	8	5236	5243	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
108	NC_014539	CTG	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728079
109	NC_014539	GGT	2	6	5262	5267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307728079
110	NC_014539	GCC	2	6	5279	5284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728079
111	NC_014539	ACG	2	6	5288	5293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
112	NC_014539	GC	3	6	5297	5302	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
113	NC_014539	GGC	3	9	5346	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
114	NC_014539	GAAGC	2	10	5377	5386	40 %	0 %	40 %	20 %	307728079
115	NC_014539	GC	3	6	5467	5472	0 %	0 %	50 %	50 %	307728079
116	NC_014539	CGA	2	6	5505	5510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
117	NC_014539	GCG	2	6	5582	5587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
118	NC_014539	GCG	2	6	5600	5605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728079
119	NC_014539	GCA	2	6	5609	5614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
120	NC_014539	GAACG	2	10	5665	5674	40 %	0 %	40 %	20 %	307728079
121	NC_014539	AGC	2	6	5681	5686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
122	NC_014539	AGC	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
123	NC_014539	GAC	2	6	5730	5735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
124	NC_014539	ACG	2	6	5806	5811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728079
125	NC_014539	GAT	2	6	5821	5826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728079
126	NC_014539	GCGG	2	8	5865	5872	0 %	0 %	75 %	25 %	307728079
127	NC_014539	CGT	2	6	6230	6235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728080
128	NC_014539	GCC	2	6	6298	6303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728080
129	NC_014539	TCG	2	6	6315	6320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728080
130	NC_014539	CATCC	2	10	6334	6343	20 %	20 %	0 %	60 %	307728080
131	NC_014539	AAG	2	6	6419	6424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728080
132	NC_014539	TTG	2	6	6454	6459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728080
133	NC_014539	AGA	2	6	6779	6784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728080
134	NC_014539	GCC	2	6	6793	6798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307728080
135	NC_014539	GAA	2	6	6868	6873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728080
136	NC_014539	TGA	2	6	6932	6937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728080
137	NC_014539	TCA	2	6	6955	6960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728080
138	NC_014539	TGA	2	6	7020	7025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728080
139	NC_014539	ACC	2	6	7105	7110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307728080
140	NC_014539	TA	3	6	7130	7135	50 %	50 %	0 %	0 %	307728080
141	NC_014539	CG	3	6	7209	7214	0 %	0 %	50 %	50 %	307728080
142	NC_014539	ACG	2	6	7227	7232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728080
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144	NC_014539	GGC	2	6	7300	7305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728080
145	NC_014539	ATG	2	6	7315	7320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728080
146	NC_014539	G	6	6	7427	7432	0 %	0 %	100 %	0 %	307728080
147	NC_014539	TCA	2	6	7445	7450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728080
148	NC_014539	GAT	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728080
149	NC_014539	GGC	2	6	7564	7569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728080
150	NC_014539	TCA	2	6	7658	7663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728080
151	NC_014539	AGTGA	2	10	7669	7678	40 %	20 %	40 %	0 %	307728080
152	NC_014539	GA	3	6	7757	7762	50 %	0 %	50 %	0 %	307728080
153	NC_014539	GCA	2	6	7803	7808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728080
154	NC_014539	AC	3	6	7859	7864	50 %	0 %	0 %	50 %	307728080
155	NC_014539	CGG	2	6	7883	7888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728080
156	NC_014539	TCGA	2	8	8012	8019	25 %	25 %	25 %	25 %	307728081
157	NC_014539	TCG	2	6	8060	8065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728081
158	NC_014539	CGG	2	6	8106	8111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728081
159	NC_014539	A	6	6	8134	8139	100 %	0 %	0 %	0 %	307728081
160	NC_014539	T	6	6	8233	8238	0 %	100 %	0 %	0 %	307728081
161	NC_014539	CTA	2	6	8242	8247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728081
162	NC_014539	CGG	2	6	8256	8261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728081
163	NC_014539	TCC	2	6	8376	8381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307728081
164	NC_014539	AGGA	2	8	8444	8451	50 %	0 %	50 %	0 %	307728081
165	NC_014539	CGA	2	6	8517	8522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728081
166	NC_014539	GAC	2	6	8527	8532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728081
167	NC_014539	GTCG	2	8	8643	8650	0 %	25 %	50 %	25 %	307728081
168	NC_014539	GCA	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728081
169	NC_014539	G	6	6	8721	8726	0 %	0 %	100 %	0 %	307728081
170	NC_014539	GTTG	2	8	8779	8786	0 %	50 %	50 %	0 %	307728081
171	NC_014539	ATG	2	6	8842	8847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728082
172	NC_014539	TGT	2	6	9025	9030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728082
173	NC_014539	T	7	7	9044	9050	0 %	100 %	0 %	0 %	307728082
174	NC_014539	CG	3	6	9054	9059	0 %	0 %	50 %	50 %	307728082
175	NC_014539	GCA	2	6	9123	9128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728082
176	NC_014539	CGCTG	2	10	9131	9140	0 %	20 %	40 %	40 %	307728082
177	NC_014539	TGC	2	6	9172	9177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728082
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180	NC_014539	CGT	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728082
181	NC_014539	GTC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728082
182	NC_014539	CAA	2	6	9417	9422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728082
183	NC_014539	A	6	6	9421	9426	100 %	0 %	0 %	0 %	307728082
184	NC_014539	GCA	3	9	9539	9547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728082
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186	NC_014539	ATA	2	6	10092	10097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307728083
187	NC_014539	ATGT	2	8	10108	10115	25 %	50 %	25 %	0 %	307728083
188	NC_014539	GTT	2	6	10259	10264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728083
189	NC_014539	GATT	2	8	10284	10291	25 %	50 %	25 %	0 %	307728083
190	NC_014539	ATC	2	6	10315	10320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728083
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192	NC_014539	ATTCCG	2	12	10394	10405	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307728083
193	NC_014539	ACC	2	6	10426	10431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307728083
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198	NC_014539	TAT	2	6	10769	10774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307728083
199	NC_014539	ATA	2	6	10804	10809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307728083
200	NC_014539	GAT	2	6	11114	11119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728084
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219	NC_014539	CAG	2	6	12263	12268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728086
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241	NC_014539	GTGC	2	8	13779	13786	0 %	25 %	50 %	25 %	307728087
242	NC_014539	TGA	2	6	13797	13802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307728087
243	NC_014539	GATAGC	2	12	13839	13850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307728087
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245	NC_014539	CTGG	2	8	14018	14025	0 %	25 %	50 %	25 %	307728087
246	NC_014539	GCG	2	6	14115	14120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728087
247	NC_014539	ATC	2	6	14174	14179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728087
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250	NC_014539	CAT	2	6	14344	14349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307728087
251	NC_014539	TG	3	6	14524	14529	0 %	50 %	50 %	0 %	307728088
252	NC_014539	TCT	2	6	14600	14605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307728088
253	NC_014539	TGCC	2	8	14693	14700	0 %	25 %	25 %	50 %	307728088
254	NC_014539	CGT	2	6	14719	14724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728088
255	NC_014539	CAA	2	6	15027	15032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728088
256	NC_014539	TGC	2	6	15035	15040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728088
257	NC_014539	TTG	2	6	15091	15096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728088
258	NC_014539	AGCG	2	8	15193	15200	25 %	0 %	50 %	25 %	307728088
259	NC_014539	CAA	2	6	15212	15217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307728088
260	NC_014539	TCG	2	6	15238	15243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728088
261	NC_014539	TCG	2	6	15451	15456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728088
262	NC_014539	ACG	2	6	15487	15492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728088
263	NC_014539	GAA	2	6	15507	15512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307728088
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266	NC_014539	TTG	2	6	15610	15615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307728089
267	NC_014539	TGC	2	6	15802	15807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307728089
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278	NC_014539	GCGA	2	8	16415	16422	25 %	0 %	50 %	25 %	307728089
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281	NC_014539	ACG	2	6	16502	16507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307728089
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289	NC_014539	A	6	6	17475	17480	100 %	0 %	0 %	0 %	307728091
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383	NC_014539	TGCG	2	8	22768	22775	0 %	25 %	50 %	25 %	307728095
384	NC_014539	CG	3	6	22806	22811	0 %	0 %	50 %	50 %	307728095
385	NC_014539	GCG	2	6	22922	22927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307728095
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